Les polyphosphates contiennent plusieurs atomes de phosphore reliés les uns aux autres par un pont oxygène. Le polymère de phosphate inorganique contient généralement de 3 à 15 unités. Les polyphosphates contiennent des atomes d’oxygène chargés négativement qui attirent les cations chargés positivement tels que le calcium, le fer, etc. Cette attraction peut efficacement séquestrer (se combiner) avec les cations, formant un complexe qui interfère avec la formation des dépôts. Une concentration seuil doit être atteinte avant que les polyphosphates puissent empêcher l’entartrage du carbonate de calcium à des concentrations avec de faibles niveaux de sursaturation. De la même manière, le polyphosphate se combine avec le fer et le manganèse pour éviter les taches rouges et noires, respectivement. L’efficacité des polyphosphates est limitée par la réversion en orthophosphate dans certaines conditions de fonctionnement.